Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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CTF1Q16619 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 MIR4435-2HG-219ENST00000609220 883 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 ZNF710-AS1-202ENST00000620791 2133 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CTF1Q16619 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CTF1Q16619 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CTF1Q16619 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CTF1Q16619 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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