Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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SS18Q15532 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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SS18Q15532 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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SS18Q15532 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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SS18Q15532 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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SS18Q15532 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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SS18Q15532 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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SS18Q15532 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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SS18Q15532 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SS18Q15532 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SS18Q15532 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SS18Q15532 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SS18Q15532 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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