Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 MEG8-201ENST00000414488 800 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 BX005266.3-201ENST00000443013 1075 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 MED28P7-201ENST00000456611 530 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDCD1Q15116 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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