Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms