Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 GAPDHP16-201ENST00000448152 962 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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