Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
LMAN2Q12907 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms