Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms