Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC093752.1-213ENST00000503038 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL356309.1-201ENST00000425153 339 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC012158.1-202ENST00000482431 1132 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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