Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 EIF3EP2-201ENST00000423042 1814 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AL357153.1-201ENST00000500016 2941 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 OR4C1P-202ENST00000641065 1569 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.4 ms