Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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