Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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SH3BP1Q9Y3L3 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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SH3BP1Q9Y3L3 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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SH3BP1Q9Y3L3 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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SH3BP1Q9Y3L3 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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SH3BP1Q9Y3L3 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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SH3BP1Q9Y3L3 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
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SH3BP1Q9Y3L3 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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