Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
VAX2Q9UIW0 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms