Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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