Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 OR2H1-204ENST00000396792 1294 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL359715.1-201ENST00000404330 555 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 MRPL32P1-201ENST00000406301 247 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 MTERF4-205ENST00000407095 799 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC134879.1-201ENST00000426062 394 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 SDHC-204ENST00000432287 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 LINC00271-203ENST00000438618 1202 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL391863.1-202ENST00000457427 612 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RPL23AP80-201ENST00000495605 424 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 ARHGEF3-214ENST00000497267 2197 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL049844.1-201ENST00000545614 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 LINC01917-201ENST00000565170 1037 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC243829.2-201ENST00000617914 470 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
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UBXN4Q92575 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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UBXN4Q92575 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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UBXN4Q92575 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 RNA5SP518-201ENST00000515957 119 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 SCARNA18.2-201ENST00000516882 84 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC091932.1-201ENST00000569381 427 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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