Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC114546.2-201ENST00000560683 477 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC116348.1-201ENST00000562525 528 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 FRG2HP-201ENST00000568807 832 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC005670.1-201ENST00000572349 395 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC087392.2-201ENST00000573877 585 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RN7SL744P-201ENST00000577604 267 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RPL36-204ENST00000579446 452 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PDLIM1P3-201ENST00000582370 599 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC016590.1-202ENST00000586324 525 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC010615.4-201ENST00000600810 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC00649-212ENST00000601471 538 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MZT1P1-201ENST00000603781 246 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL109930.1-201ENST00000606932 724 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PDZK1P1-203ENST00000616036 577 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 BSNDP3-201ENST00000617487 364 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 FP236315.1-201ENST00000623723 457 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL031719.2-201ENST00000624488 476 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 NBDY-204ENST00000637096 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL161891.1-201ENST00000621575 4636 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 CEP95-201ENST00000553412 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
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ANKRD39Q53RE8 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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ANKRD39Q53RE8 GUCY2F-201ENST00000218006 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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ANKRD39Q53RE8 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 MITF-214ENST00000472437 1995 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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ANKRD39Q53RE8 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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ANKRD39Q53RE8 COX6A1P3-201ENST00000404167 293 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 NIP7P3-201ENST00000404319 515 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 SLC25A26-203ENST00000413054 1096 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 ACTG1P1-201ENST00000415794 1129 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 LINC00676-201ENST00000416090 474 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 CRIP1P3-201ENST00000416794 220 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC007384.1-202ENST00000417026 891 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 LINC01871-201ENST00000417930 243 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC008781.1-201ENST00000422040 621 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 SNHG17-204ENST00000423536 517 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC011747.1-201ENST00000425678 565 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 SNX18P9-201ENST00000440580 835 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC068279.1-201ENST00000444323 888 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 DNAJC9-AS1-202ENST00000457147 762 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RPS10P16-201ENST00000483812 496 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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