Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
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