Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ODF2L-201ENST00000294678 4267 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ARID2-201ENST00000334344 8642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 COL11A1-203ENST00000370096 7286 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 CD2-202ENST00000369478 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL080317.3-201ENST00000607434 4315 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ERG-203ENST00000398905 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZNF469-202ENST00000565624 13279 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 GREB1L-209ENST00000580732 8749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 LRRC37A2-201ENST00000333412 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 BACH2-210ENST00000537989 9108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 FN1-212ENST00000446046 7952 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZFHX3-201ENST00000268489 16064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 FN1-205ENST00000357867 7898 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZBTB40-201ENST00000374651 8368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 FLNB-214ENST00000493452 7402 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
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