Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 MALAT1-203ENST00000544868 480 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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