Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 PAIP2B-201ENST00000244221 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CACNA1SQ13698 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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