Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 LRP2BP-201ENST00000328559 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 CFAP54-202ENST00000524981 9766 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 MFN1-205ENST00000471841 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 OR8G1-202ENST00000641972 5055 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 UNC79-206ENST00000621021 7377 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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