Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
TWF1Q12792 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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TWF1Q12792 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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TWF1Q12792 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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TWF1Q12792 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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TWF1Q12792 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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TWF1Q12792 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TWF1Q12792 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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