Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HDGFL3Q9Y3E1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms