Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MED16Q9Y2X0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms