Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHKBQ9Y259 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHKBQ9Y259 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHKBQ9Y259 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHKBQ9Y259 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHKBQ9Y259 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHKBQ9Y259 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHKBQ9Y259 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHKBQ9Y259 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHKBQ9Y259 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHKBQ9Y259 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms