Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms