Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO40Q9UH90 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms