Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CFDP1Q9UEE9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms