Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms