Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms