Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHPF2Q9P2E5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms