Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms