Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
DUOX2Q9NRD8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC29■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC29■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC29■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DUOX2Q9NRD8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms