Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA8

EIF4ENIF1, Eukaryotic translation initiation factor 4E transporter, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4ENIF1Q9NRA8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4ENIF1Q9NRA8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4ENIF1Q9NRA8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms