Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTA1Q9NP79 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTA1Q9NP79 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms