Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms