Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms