Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EHD4Q9H223 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms