Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFDQ9GZP0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
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