Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

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Length 174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
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C20orf27Q9GZN8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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C20orf27Q9GZN8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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C20orf27Q9GZN8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
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C20orf27Q9GZN8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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C20orf27Q9GZN8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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C20orf27Q9GZN8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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C20orf27Q9GZN8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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C20orf27Q9GZN8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C20orf27Q9GZN8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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