Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2J2Q9GZM3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms