Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms