Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF17Q9BXT8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms