Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VN1R3Q9BXE9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms