Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms