Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SYCP2Q9BX26 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms