Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MESP1Q9BRJ9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms