Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms