Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms