Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms