Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 ETFRF1-207ENST00000556351 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms